تالاب انزلی به دلیل موقعیت جغرافیایی از نظر میزان بالای رطوبت و آب با هیچ یک از تالابهای ایران قابل مقایسه نیست اما ورود هر روزه آلایندههایی همچون پسابهای صنعتی، کشاورزی و خانگی از طریق ۱۱ رودخانه گیلان از جمله رودخانههای گوهررود و زرجوب موجب شده است که تالاب انزلی این روزها با آلودگی های زیادی دست و پنجه نرم کند.