رودخانه کرج بهعنوان یکی از پرآبترین رودخانههای دامنه جنوبی البرز از سال ۱۳۴۶ در ردیف رودخانههای تحت حفاظت سازمان محیطزیست قرار گرفته است. این رودخانه حفاظتشده، تأمینکننده بخشی از آب شرب تهران، کرج و آب کشاورزی مناطق همجوار است و با توجه به ساختار بستر و مشخصههای هیدرولوژیکی و برخورداری از پتانسیلهای بالقوه زیستی مثل قدرت خود پالایی و اکسیژن سرشار، توانسته اکوسیستمی درخور زیست انواع پرندگان آبزی، کنار آبزی و آبزیانی که در نوع خود کمنظیر هستند، باشد.